A estrutura administrativa e acadêmica principal está concentrada no ICHS – campus Seropédica. O IM e o ITR estão integrados de modo a garantir o desenvolvimento de atividades acadêmicas, em especial de pesquisa, através da disponibilidade de seus espaços e bibliotecas. Assim, são ampliadas as possibilidades de apoio para projetos de mestrado e doutorado que tenham essas regiões como interesse de pesquisa.